Le marais Saint-Éloi rempli des fonctions écologiques importantes. Tout d'abord, il agit comme un bassin de sédimentation pour l'ensemble des eaux du petit bassin versant à vocation agricole qui s'y déversent. En effet, ce milieu humide joue un rôle primordial au niveau de la qualité de l'eau qui se jette dans le fleuve puisqu'il retient les particules et les fertilisants provenant du milieu agricole. De plus, il permet de régulariser les niveaux d'eau en absorbant les surplus lors des crues printanières. Finalement, il fournit un habitat à de nombreuses espèces de plantes et d'animaux. Bien que l'importance de ce site soit connue de la population environnante, il est néanmoins en proie à des pressions qui sont susceptibles de compromettre son intégrité écologique. Ces différentes pressions, soit l'agriculture, la proximité d'une zone habitée et le comblement du marais au fil du temps, seront décrites dans ce document.
Le Comité ZIP Les Deux Rives a réalisé un plan de conservation des habitats fauniques du marais Saint-Éloi qui s’adresse aux gestionnaires et aux acteurs du milieu et propose des orientations et des recommandations en vue d’assurer la pérennité et l'amélioration des ressources naturelles présentes dans ce secteur.
